Doc2Vec

医学中央雑誌の抄録

論文の抄録を集めてコーパスを作成し、Doc2Vecで類似文書検索を行ったのでまとめておく。抄録コーパス wakati_texts の作成についてはここの「データセットの作成」を参照のこと。

from gensim.models.doc2vec import Doc2Vec, TaggedDocument

documents = [TaggedDocument(doc, [i]) for i, doc in enumerate(wakati_texts)]

model = Doc2Vec(dm=0, vector_size=50, min_count=1, alpha = 0.025)
model.build_vocab(documents)
model.train(documents, total_examples=model.corpus_count, epochs=100)

# k番目の文書と類似の文書
k = 10
print(documents[k])
for i, x in model.docvecs.most_similar(k, topn=3):
  print(i, x, documents[i])

実行結果は次のようになる。

TaggedDocument(リツキシマブ ( RTX ) 晩期 合併症 発 性 中 球 減少 症 ( late - onset neutropenia : LON ) , ネフローゼ 症候群 骨髄 所見 報告 . , RTX 投与 後 LON ( R - LON ) 発症 機 序 未知 . 難治 性 ネフローゼ 症候群 RTX 投与 3 か月 後 LON 症例 骨髄 検査 施行 . 骨髄 所見 末梢 血 CD 20 細胞 推移 R - LON 発症 機 序 考察 . 症例 7 歳 女児 . 難治 性 ネフローゼ , RTX ( 1 回 375 mg / m 2 ) 4 回 投与 . 最終 投与 2 か月 半 後 発熱 Grade IV 顆粒 球 症 . 骨髄 検査 骨髄 球 系 分化 停止 所見 . とき 末梢 血 CD 20 細胞 0 . 05 % , 1 か月 後 1 . 5 % , 2 か月 後 7 % 正常 化 . 以上 B 細胞 回復 直前 LON 発症 . RTX 投与 後 B 細胞 回復 前 白血球 数 , 白血球 分 画 注意 必要 .( 著者 抄録 ), [10])
252 0.5759676694869995 TaggedDocument(最近 筆者 ら , めまい 自分 部屋 徘徊 症例 経験 発症 後 3 日 目 MRI , 右 海馬 , 拡散 強調 像 ( diffusion - weighted image ; DWI ) 信号 , ADC ( apparentdiffusion coefficient ) map 信号 発症 後 10 日 目 , 発症 後 17 日 目 MRI , FLAIR ( fluid . attenuated inversion recovery ) 像 , T 2 強調 像 脳 梗塞 所見 海馬 一過 性 虚 血 病巣 めまい 報告 例 , 投稿 ( 著者 抄録 ), [252])
378 0.5115715861320496 TaggedDocument(高齢 化 弁膜 症 性 心房 細 動 ( nonvalvular atrial fibrillation : NVAF ) 患者 心 原 性 脳 塞栓 はじめ 血栓 塞栓 症 合併 比率 増加 ため 臨床 現場 凝固 製剤 ワルファリン こと 日常 的 ワルファリン 治療 域 維持 コントロール 困難 休 薬 減 薬 必要 際 管理 複雑 ため 正確 回 プロトロンビン 時間 ( prothrombin time - international normalized ratio : PT - INR ) 凝固 能 モニタリング こと 不可欠 ワルファリン 療法 中 PT - INR 低下 ワルファリン 用量 不足 脳 梗塞 ( cerebral infarction : CI ) 一過性脳虚血発作 ( transient ischemic attack : TIA ) stroke ( 卒 中 ) 難治 性 NVAF 患者 13 年間 長期間 臨床 経過 報告 NVAF 発症 stroke 成り行き 観察 この間 様々 イベント 反省 臨床 医 注意 喚起 ( 著者 抄録 ), [378])
258 0.4994485378265381 TaggedDocument(症例 特記 既往 41 歳 男性 2013 年 毎回 3 ～ 5 分間 持続 急 右 上下 肢 脱力 訴 一過性脳虚血発作 診断 5 日間 入院 アスピリン 投与 退院 4 日 後 再発 ため 入院 NIHSS 評価 スコア 7 中等 度 白血球 数 減少 ヘモグロビン 軽度 減少 明らか 血小板 減少 播種 性 血管 内 凝固 症候群 アラニンアミノトランスフェラーゼ グルタミン酸 オキサロ 酢酸 トランスアミナーゼ 数値 上昇 骨髄 スメア 末梢 血 スメア 所見 骨髄 球 核 型 それぞれ 89 %、 51 % こと t ( 15 ; 17 )( q 22 ; q 12 ) 急性 骨髄 球 性 白血病 診断 臨床 所見 進行 性 神経 症候 増悪 意識 混濁 尿 失禁 入院 24 時間 以内 NIHSS スコア 10 増悪 頭部 MRI 検査 播種 性 信号 領域 観察 ため オールトランスレチノイン 酸 導入 化学 療法 開始 入院 6 日 目 死亡, [258])